El IdISBa impulsa la innovación a través de su unidad Unidad de Innovación y Transferencia de Resultados de Investigación (UITRI), encargada de gestionar patentes, proteger resultados de investigación y facilitar la colaboración con la industria. Cuenta con un sistema propio para registrar invenciones y participa en redes como la del Red de Innovación del Instituto de Salud Carlos III (ISCIII) y la Enterprise Europe Network para promover la transferencia tecnológica.